Google Base与科学家数据共享

下面是Nature 11月份上一篇新闻报道的翻译，Google的数据库遍布世界各地，Google Base让人们联想到Semantic web，而这两者加起来又让人们联想到“数据网格”，也许Google将是数据网格被普通人使用的开始. 原文标题和地址:Google Makes data free to all Google在上星期启动了它的一项新服务——Google Base。它允许任何人免费上载文件到Google服务器，使得数据立即可以被检索。虽然这项服务主要定位是在线市场：比如工作和居家，科学家们说这项服务也蕴含了巨大的针对科学数据进行共享的潜力，并且可能使得整个Web变得更加具备“智能”性。 Google Base允许用户上载数据，并允许用户用简单的标签来描述数据，其他人可以在搜索中使用这些标签。它还让用户随时增加字段，以让这些非结构化的数据变为结构化的数据。一个包含一篇科学文章的网页也许会利用“作者”、“期刊”、“出版物”或者其他关于文章的元数据信息的字段。 这也许听起来并不是一项复杂的技术。但是鼓吹者认为它使得Web内容在整体上变为结构化的数据库。它开始使得科学家们共享数据、以便于搜索的形式存储数据变得更简单。 David Haussler（加利福尼亚大学生物科学与工程中心的director）说，在共享数据方面，科学家们仍处在一个“黑暗的时代”。那些存在于基因序列、蛋白质结构、天文数据等几个相对很少的大型世界级数据库之外的数据，最终以附随期刊文章的辅助表格的形式从这个世界上消失。他说，“它们以不可索引、不一致、不方便的形式存储，如果说它们真的被保存的话”。 网格概念的创始人Ian Foster说，Google Base或者类似的服务或许能够发挥它的作用。在“网格”中，很多计算机协同起来提供大量的处理能力和数据存储能力。Ian Foster认为，科学研究急需一些能够使得个人、团体创建和共享数据以及处理这些数据的程序变得更容易的东西。 提供一种简单地能够交互检查多种类、多来源数据的途径能够给科学研究带来真正的实惠，来自明尼苏达州大学生物信息学的Paul Myers说，“我认为Google在这方面是超前的，这个工具的重要性将会变得不可估量”。 Smart Systems(智能系统) Google Base也许还意味着是Web向智能网络前进的一个低调谨慎的开始。Web向智能网络发展的思想最初是由Web的创始人Tim Berners-Lee于1989年在欧洲高性能粒子物理实验室CERN提出的。 网页的设计只是为了方便人的阅读，并不包含那些计算机能够处理的附加描述信息。这种设计思想限制了它们的用处，尤其是对那些搜索网页的用户来说。例如，现在我们不能够通过Web搜索“关于蛋白质CCR5激活PYK2实验的，并被同行评论的论文”。当我们在线阅读论文时，不能够让计算机重新画一个概念图以包含一些额外的数据集。 Berners-Lee倡导一种被称为“Semantic Web（语义网）”的东西，它将网页加上标签，从而使得计算机能够理解网页的内容。这意味着计算机能够询问那些网页上的数据是否满足一定的条件，以及从不同的数据源进行数据的融合。 但是，虽然语义网在生物信息学等一些专门的领域很快建立了基础，它仍然没有广泛地推行。科学家们认为，Google Base能够改变这种局面，因为它能够将大量结构化的网页聚集起来。“最大的问题在于这样的服务是否能够对引导语义网起到作用”，Greg Tyrelle,台湾Chang Guan大学的一位生物信息科学家说。 Google power “对包括科学数据在内的任意的数据进行在线的灵活存储，是近两年一个主要的研究领域”，Leigh Dodds，Ingenta出版社的一个Web专家认为。“Google Base将其扩展到每个人，使得这项研究推进了一大步”，虽然他还说希望看到政府、大学也推动类似的服务，而不是只留给Google来作。 但是，科学家指出，Google在W3C 组织关于Semantic Web标准制定工作方面的缺席是突出的。他们还承认，和那些专业的数据库，比如GenBank, UniProt等比起来，现在Google Base服务还是相当粗糙的。你所能做的只是发布信息，搜索信息，它没有提供对这些数据实行抽取、计算的途径。 但很多研究者相信这种情况很快就会改变。Google已经对其他的服务公开了其API接口，同样，对Google Base 服务也不会例外。它将允许任何人写可以访问Google数据库的程序，将Google数据库中的数据同其他数据混合、匹配，以创造出完全不同的新产品。 “如果Google 意图将Google Base变为不再仅仅是一个查询信息的工具，而是供科学家发现数据的东西，更多的工作需要去做。”耶鲁大学生物信息学科学家Mark Gernstein说。 但是根据Foster的观察，这样的进程将会很快发生。“Google 有很多相关技术和专家，如果它组建了合适的团队并投入足够的资源，就一定能产生巨大的影响”。 “Google Base现在看起来还有点简单，而且还不清楚怎样去接入Google power，但是这毕竟已经开始了”，Myers说。 translated by Jacquette

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